Hij regisseert en produceert documentaires en reportages, schrijft artikelen en columns voor kranten, bladen en deze website. Hij is in te huren als journalistieke mentor/ coach maar ook als (interim) eindredacteur en adviseur/ bemiddelaar bij conflicten op redacties of binnen media- organisaties. Nijpels geeft cursussen en doceert onderzoeksjournalistiek en adviseert voor op waarheid gebaseerde films, series en boeken.
Nijpels werkte in vaste dienst als verslaggever, regisseur en onderzoekjournalist voor Netwerk, Brandpunt, Profiel en Reporter (KRO). Aan dat programma gaf hij leiding tot medio 2015. Daarna begon hij voor zichzelf. In 2016 won hij samen met collega Huub Jaspers (Argos, VPRO), De Loep, de Nederlands/Vlaamse prijs van de Vereniging voor Onderzoeksjournalisten (VVOJ) voor de documentaire ‘Waarom Srebrenica moest vallen’
De jury noteerde in haar rapport: “Deze documentaire komt griezelig in de buurt van perfecte onderzoeksjournalistiek. Het Argosteam heeft de geschiedenis herschreven. Aanhoudend, diepgravend, goed in beeld gebracht, alle partijen aan het woord gelaten, revelerend en relevant. Kortom: verplichte kost op voorschrift van de Loepjury.” De documentaire was aanleiding voor aanvullend onderzoek door het NIOD naar de val van de enclave.
Nijpels werkte in oorlog -en crisisgebieden als Israël, voormalig Joegoslavië en Afghanistan
In 2013 won Nijpels, samen met collega Marco de Lange, De Loep voor ‘Mayday, mayday’ over Ryanair. Het tweeluik leidde tot een slepende rechtszaak die de luchtvaartmaatschappij, na drie jaar procederen, verloor.
In 2000 ontving hij, op het televisiefestival in Monte Carlo een nominatie voor een reportage over klokkenluider Paul van Buitenen tijdens de val van de Europese Commissie. Vanaf 1990 maakte Nijpels zo’n honderd reportages en documentaires. Onder meer over Srebrenica, oud- bokser Rudi Lubbers, de Hofstadgroep, de Joint Strike Fighter (JSF), Gladio, het WK’74, Afghanistan en de Nederlandse missie in Uruzgan, luchtvaartmaatschappij Ryanair, de ramp met containerschip MSC Zoë.